EVENTO
Análise transcriptômica e interatômica de diferentes espécies de Hevea inoculadas com Microcyclus ulei
Tipo de evento: Defesa de Tese de Doutorado
Plantas são alvos frequentes de herbívoros e patógenos. As diferentes estratégias vegetais dedefesa contra patógenos visam impedir sua proliferação e a colonização, além de conferirresistência de longa duração. A seringueira (Hevea spp), que se destaca por sua produção deborracha natural, é bastante afetada pelo fungo Microcyclus ulei, causador do Mal-das-folhas.Esta doença representa uma ameaça a plantações de seringueira, uma vez que o patógeno atacaprincipalmente folhas jovens podendo provocar a morte da árvore ainda em período produtivo.Dentre os genótipos de seringueira, alguns são considerados resistentes e outros suscetíveis aoMal-das-folhas. Assim, os objetivos principais deste trabalho são ampliar o conhecimento sobre aresposta da seringueira ao ataque do fungo causador do Mal-das-folhas e buscar genespotencialmente envolvidos com sua resistência através da análise do transcriptoma e dointeratoma de folhas de diferentes genótipos de Hevea spp. O sequenciamento NGS e montagemdo transcriptoma da folha de 3 genótipos resistentes (F4542 - H.benthamiana, PA31 - H.pauciflora,MDF180 - H.brasiliensis) e 1 suscetível (PB314 H.brasiliensis), nas condições inoculado e nãoinoculadocom Microcyclus ulei, geraram um total de 50.239 contigs, dos quais cerca de 75%(33.988) dos contigs de interesse tiveram alguma função anotada. A anotação de termos GOencontrou 637 sequências na categoria ``Resposta de defesa'' e 155 na ainda mais específicacategoria ``Resposta de defesa a fungos''. O alto percentual de similaridade encontrado nacomposição do transcriptoma inoculado dos quatro genótipos (37% dos contigs) sugere que aresistência da seringueira ao Mal-das-Folhas é causada principalmente pela regulação dos níveisde expressão gênica. A análise dos níveis estimados dos transcritos nas condições inoculada enão inoculada dos genótipos resistentes indicam também que as mudanças induzidas pelopatógeno no perfil de expressão do transcriptoma de F4542 e PA31 são menos pronunciadas doque em MDF180, um resultado compatível com as lesões observadas. A análise de expressãodiferencial revelou ainda um total de 1.795 contigs diferencialmente expressos nos genótiposestudados. Apesar do baixo percentual (22%) de sequências de seringueira com ortólogo emArabidopsis thaliana, foi construído o primeiro interatoma de seringueira a partir dos interólogosdesta espécie modelo. A rede de seringueira, formada por um total de 5.382 proteínas e 72.702interações entre elas, apresenta características comumente encontradas em outras redesbiológicas como a distribuição de conectividade segundo lei de potência e rede do tipo ``mundopequeno''. A modularidade também foi observada no interatoma de Hevea spp, com a detecçãode módulos funcionais envolvidos em processos biológicos como metabolismo, transcrição etradução, transdução de sinais, respostas a hormônios e estresse. A associação de critérios comoa função da proteína, sua presença nos genótipos resistentes, seu perfil de expressão eposicionamento nas redes de seringueira permitiu ainda a identificação de 30 sequênciaspotencialmente envolvidas com a resposta e resistência da seringueira ao patógeno M.ulei, queconstituem alvos de melhoramento para criar cultivares resistentes.
Data Início: 18/05/2015 Hora: 10:00 Data Fim: 18/05/2015 Hora: 14:00
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Auditorio A
Aluno: Fernanda alves de Freitas Guedes - LNCC - LNCC
Orientador: Dominique Garcia - - Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Participante Banca Examinadora: Diego Bonatto - - Evandro Novaes - - Marcelo Trindade dos Santos - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Marcio Alves Ferreira - Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
